Комарне виникло у XII-XIII ст. У ІІ половині XIV ст. воно належало руському воєводі Станіславу Ходецькому, котрий 1493 року добився від короля Казимира Ягайла переведення міста з руського на магдебурзьке право.  Завдяки йому цього ж року був збудований перший дерев’яний костел.

Мурований костел у Комарному спорудили на кошти Миколи Остророга, ймовірно, за участю львівського архітектора Войцеха Капіноса. 1658 р. храм був освячений.

У середині XVIII ст. перед фасадом збудували дзвіницю та обгородили муром прилеглу територію з цвинтарем та парафіяльним будинком.  Після пожежі 1774 р. відбулась реставрація, яка завершилась у 1794 р. Наступну реставрацію здійснили у 30-і рр. XX ст. за кошти парафіян та родини Лянцкоронських.

У 1946 р. храм закрили. Костел використовувався як складське приміщення для меблів та господарського інвентаря.  У 1992 р. храм віддали римсько-католицькій громаді, але невдовзі храм передали греко-католицькій спільноті.